İl merkezinde Valilik önderliğinde, Sanayi ve Ticaret Bakanlığının kredi desteği ile yapımı sürdürülen Organize Sanayi Bölgesi, 85 hektar alanda 68 parseldir ve 50 fabrika kapasitelidir. Şu anda 30 fabrika üretime geçmiştir. 19 fabrika inşa halinde olup, 1 arsa ise boş durumdadır. Bucak Organize Sanayi Bölgesi için 845.000 metrekarelik alan tespiti yapılmış, bunun 800.000 metrekaresi kamulaştırılmış, 45.000 metrekaresinin ise kamulaştırma işlemleri devam etmektedir. Burdur ilinde biri merkez ilçede diğerleri Bucak, Tefenni, Karamanlı ve Ağlasun’da olmak üzere mevcutta 5 adet küçük sanayi sitesi bulunmaktadır. Burdur İl sınırları içerisinde faaliyette olan 5 adet müstakil sanayinin AAT bulunmaktadır. Burdur Belediyesi AAT inşaat aşamasındadır. Şu anda birkaç fabrika göle atıklarını vermektedir. Önde gelen kirleticiler, Burdur’daki şeker ve süt fabrikalarıdır. Bunların atıklarında yüksek oranda nitrat ve fosfat vardır. Yine Burdur’daki Et ve Balık Kurumu’na ait bir kombina organik atık boşaltmaktadır. Ancak bu sular çevredeki bahçelerin sulanmasında kullanılmakta ve kirlilik yükü azaltılmaktadır.

Gölün 15 km kuzeyindeki Keçiborlu’da bulunan kükürt madeni ve fabrikasından çıkan inorganik atıklar, Adalar Çayı ile Burdur Gölü’ne taşımakta ve döküldüğü yerde gölün pH seviyesini düşürmektedir (bu dere birkaç yıldır göle ulaşmamaktadır). Keçiborlu kükürt fabrikası yakın dönemde düşük kapasitede çalışmış olup, kapatılması söz konusudur. Gölü kirletici diğer kaynaklar, tarım arazilerinden dönen sular ve Burdur kentinin atıklarıdır. Kanalizasyonu tamamlanmakta olan Burdur ile şeker ve süt fabrikası için arıtma tesisleri kurulması gündemdedir. Ancak, bunların tam çalışır hale gelmesi birkaç yıl daha alacaktır. Kentin güneybatısında göle yakın alanlarda yapılan çok sayıda binanın göldeki kirlilik sorununu arttırması söz konusudur.

Burdur Gölü genel su kalite parametreleri açısından son 20 yılda çok fazla bir değişim göstermemekle beraber göl seviyesinin düşüşüne bağlı olarak ağır metal konsantrasyonlarında artış eğilimi göstermektedir. Esas itibariyle gölde su hacminin azalmasına bağlı olarak konsantrasyonların daha fazla artması beklenirken bu artışın gölün yeraltı suyu beslemesi ve meteorolojik faktörler nedeniyle sınırlı olduğu düşünülmektedir. Ağır metallerin zararlı etkileri dikkate alındığında her ne kadar gölde üretim olmasa da göle deşarj edilen atıksuların kontrol edilmesi gölün ekolojisinin sürdürülebilirliği açısından önemlidir.

Ayrıca 1990’lara kadar gölde yoğun olarak avcılık yapılmaktaydı. 1993’deki koruma statüsüyle gelen av yasağı ve daha önemli merkezi Ankara’daki Av ve Yaban Hayatı Koruma, Geliştirme ve Tanıtma Vakfı ile Burdur Belediyesi’nin yaptığı bilinçlendirme ve denetim çalışmaları sonucunda av baskısı çok büyük ölçüde azalmıştır.

Havza Planlama Hedefleri:
Havzada atıksu arıtma tesisini kurmamış belediyeler Çevre Kanunda belirtilen sürelerde bu tesisleri işletmeye almakla yükümlüdürler. Bu çerçevede Bakanlığımızca yapılan çalışmalar sonucunda Kanunda öngörülen sürelerde atıksu arıtma tesisi ile hizmet verilen belediye nüfusunun havzada bulunan toplam belediye nüfusuna oranı baz alınarak ulaşılması planlanan hedefler verilmektedir.

Havzada Bulunan Atıksu Arıtma Tesisleri İçin Yatırım İhtiyacı:
AB Entegre Çevre Uyum Stratejisi’nde bulunan atıksu yatırım ihtiyacı tablosu Çevre Kanunun getirdiği kısıtlamalar göz önünde bulundurulup, tekrar değerlendirilerek, atıksu yatırım ihtiyacı (2007-2017) tablosu (2007-2017) oluşturulmuştur. Tablo 8’deki atıksu arıtma tesisi yatırım ihtiyacı havza nüfusuna göre hesaplanmıştır. Burdur Havzası için AAT yatırım ihtiyacı aşağıda verilmektedir.