Burdur Havzası Türkiye’nin güneybatısında yer alan en büyüğü Burdur Gölü olmak üzere Acı Göl, Salda Gölü, Akgöl, Yarışlı ve Karataş gölünün su toplama havzalarında meydana gelen alanı kapsamaktadır. Havzanın yüzey alanı 204,9 km2’dir. Havza batıda Eşler, Maymun dağları, doğuda Kestel, Çatak dağları, güneyde Rahat, Koru dağları, kuzeyde ise Boz ve Akdağların su ayırım çizgileri arasında hudutlanmaktadır. Havza toplam olarak 566.546 hektar saha kaplamakta olup, Türkiye genel yüzölçümünün %0,73 ünü teşkil etmektedir. Burdur Kapalı Havzası’nda etkili ve sürdürülebilir havza yönetimi için gerekli kapasitenin oluşturulması ve entegre havza yönetimi anlayışının geliştirilmesi önem teşkil etmektedir. Burdur Gölü, göller bölgesi göllerinden Burdur ve Isparta illeri arasında yer alan bir göldür. Burdur şehir merkezine çok yakındır. Koordinatları, 37°45' Kuzey, 30°12' Doğu'dur. Ortalama Göl Alanı 23700 ha., rakımı 857 metredir. Güneybatısına doğru Burdur'un diğer göllerinden Salda Gölü ile Yarışlı Gölü vardır.

Seyhan Havzası, Yukarı ve Aşağı Seyhan Havzaları şeklinde iki kısımda incelenebilir. Bu havzaların sınırları Zamantı Irmağı üzerindeki Göktaş Barajı ile Göksu Irmağı üzerindeki Berke Barajı ve “Köprü” mevkii arasından geçmektedir. Seyhan Havzası, Yukarı ve Aşağı Seyhan Havzaları şeklinde iki kısımda incelenebilir. Bu havzaların sınırları Zamantı Irmağı üzerindeki Göktaş Barajı ile Göksu Irmağı üzerindeki Berke Barajı ve “Köprü” mevkii arasından geçmektedir. Yukarı Seyhan havzasında nüfus yoğunluğu çok fazla olmayıp, sadece Kayseri İline bağlı küçük yerleşim yerleri bulunmaktadır. Ancak bu yöre maden yatakları bakımından oldukça zengindir. Söz konusu maden yataklarından Pınarbaşı merkez ilçe ile Karaboğaz, Büyükkaramoklu, Kılıçmehmet, Demircili ve Yahyalı İlçesi Karaköy, Delialiuşağı köyleri yöresinde krom, Yahyalı-Karaköy, Feke ve Develi-Kaleköy’de demir, Yahyalı-Taşhan, Develi-Kaleköy, Havadan ve Ayşepınar yörelerinde kurşun ve çinko cevherleri çıkarılmaktadır.

Yapılan su kalitesini belirleme çalışması kapsamında oluşturulan Küçük Menderes su kalitesinin irdelenmesinden kirliliğin yoğun olarak evsel atıksulardan, tekstil, metal, maden, zeytinyağı, süt ve süt ürünleri vs. endüstri tesislerinden ve tarımsal faaliyetlerden (ilaçlama, gübreleme ve drenaj suları) kaynaklandığı anlaşılmaktadır. Özellikle toplam fosfor, nitrit ve nitrat değerlerinin yüksek olması; nehir suyunda ötrofike bir durum olduğunun göstergesidir. Bu durum havzada yoğun olarak yapılan tarımsal faaliyetlere ve bilinçsiz aşırı gübre kullanımıyla açıklanabilir. İnorganik kirliliğin kaynaktan itibaren sanayi bölgelerinde daha fazla olduğu, küçük sanayi sitelerinin de önemli kirletici etken oluşturduğu tespit edilmiştir. Havzada yoğun olarak bulunan mevsimlik zeytinyağı tesisleriyle süt ve süt ürünleri (mandıralar) de organik kirliliği önemli ölçüde artırmaktadır. Ayrıca Torbalı Fetrek Çayı civarındaki büyük ölçekli sanayi kuruluşları, mermer işleme tesisleri nehre ciddi anlamda kirlilik yükü taşımaktadır.